使用nnUNet跑BraTS脑肿瘤分割预测TC和ET非常低的原因
使用nnUNet跑BraTS脑肿瘤分割预测TC和ET非常低,原来是预测的时候,使用了预处理后的标签。原本标签是2WT,1TC,4ET。但是预处理之后变为1WT,2TC,3ET。所以我们对于最后预测完需要变回原来的标签值。nnUNet需要改动代码位置nnunet/inference/segmentation_export.py。代码只写了我如何修改的。
python将文件从一个目录移动到另一个目录。附nnUnet使用
在使用nnUnet做BraTS2019数据集预测时,预测文件分别生成了三类文件.pkl .npz .nii.gz,我们需要的是.nii.gz文件。所以需要进行文件移动。